Tokyo este situat intr-un golf si are rauri ca trasee convenabile de transport. In prezent, cateva companii de feriboturi ofera servicii pe care turistii le pot gasi utile. Serviciile de "autobuz de apa" (水上バス, Suijō Basu) sunt o alternativa placuta la metrou atunci cand calatoriti intre destinatii apropiate de apa.
Locatiile cele mai convenabile pentru accesul cu feribotul sunt insulele artificiale din Golful Tokyo, in special districtul comercial si de divertisment Odaiba. Multe "autobuze de apa" calatoresc si pe raul Sumida, unul dintre cele mai frumoase rauri ale orasului. Raul este celebru si pentru numeroasele sale poduri care au fost proiectate diferit. Autobuzul de apa ofera acces si catre Asakusa si Ryogoku.